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PANGOLIN

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首次发布2020年4月30日,​4年前​(2020-04-30
当前版本
  • 4.3.1(2023年7月26日)[1]
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源代码库github.com/cov-lineages/pangolin
编程语言Python
许可协议GNU通用公共许可证
网站pangolin.cog-uk.io/ 编辑维基数据

PANGOLIN(Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages,中文又翻譯為彭高命名系統)是一个由Rambaut Lab成员开发的软件工具,與其相关的网络应用由位於英國南劍橋郡基因组病原体监测中心英语Centre for Genomic Pathogen Surveillance开发[2]。該工具可以被用來對严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2基因譜系英语Lineage (genetic)進行动态命名(PANGO命名法)[3]

據此命名系統的發起人之一Andrew Rambaut所說,SARS-CoV-2有數以萬計的基因體,該基因體數量可是前所未見的,由於截至2020年7月還沒有共識去為SARS-CoV-2種系命名,因此就訂出這個Pango Lineage系統來為基因體譜系命名。

参考文献

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  1. ^ Release 4.3.1. 2023年7月26日 [2023年8月1日]. 
  2. ^ Real-Time Epidemiology for COVID-19. www.pathogensurveillance.net. [22 January 2021]. (原始内容存档于2021-01-17). 
  3. ^ Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á.; et al. A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology英语Nature Microbiology. 2020, 5 (11): 1403–1407 [2021-05-15]. PMID 32669681. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. (原始内容存档于2020-12-24).